问：您好，我司在前几年通过申请向国家发改委申领了几千吨棉花关税配额，现在因涉及违法，海关要按关税配额外来计税，请问加工贸易棉花配额是否在进口关税配额数量以内？如果在的话，还会按关税配额外来计税吗？谢谢。
答：根据《农产品进口关税配额管理暂行办法》第九条，《农产品进口关税配额证》适用于一般贸易、加工贸易、易货贸易、边境小额贸易、援助、捐赠等贸易方式进口。因此，加工贸易棉花配额在进口关税配额数量以内，对于在关税配额内进口的棉花，在计税时应当适用关税配额税率，而不是关税配额外税率。
