保税指某些进口商品因为需要再出口而暂时免征进口环节税，并由进口商缴纳担保金或其它海关认可的担保，在进口商品复出口时或按规定申请补税内销后予以解除担保。而减免税是对某些纳税人或课税对象的鼓励或照顾措施，减税是减征部分应纳税款，免税是免征全部应纳税款。具体而言，保税与减免税主要有以下5种区别。

一、二者性质不同

保税货物是以在境内储存和加工成品复运出境为前提条件，而不是在国内最终使用和消费为目的。减免税货物是按照《海关法》、《进出口关税条例》、《进出口税则》和国务院发布的减免税规定实施的税收优惠，货物进口时海关按照规定免征或减征进口税，货物进口后在境内使用和消费，不再复运出境。

二、货物范围不同

保税货物是进口后保税储存或加工成品复出口的货物。而减免税货物是按照《海关法》、《进出口关税条例》、《进出口税则》和国务院发布的减免税规定范围内的进出口货物，即法定减免税货物、特定减免税货物和临时减免税货物。

三、货物种类不同

加工贸易手册项下的保税货物的种类主要是物流资产、原材料、零部件和元器件等。而特定减免税货物的种类主要是固定资产、设备、仪器和仪表等。

四、海关监管不同

特定减免税货物主要通过时效管理，到年限解除监管。而保税货物主要通过核销管理，然后复运出口解除监管。

五、海关手续不同

保税仓库在储存保税货物前应经海关批准并获得海关签发的《保税仓库登记证书》方可经营保税货物的经营业务。法定减免税货物只要是符合《海关法》、《进出口关税条例》和《进出口税则》的规定，就不需要收发货人在货物进口前办理审批手续。特定减免税货物需要事先办理减免税备案等手续。保税货物，符合进口办理保税合同登记备案条件的，海关就核发加工贸易登记手册。