《中华人民共和国海关行政赔偿办法》对查验赔偿相关情况进行了具体规定，您可参阅。如果属于海关责任，海关应该赔偿。如果不属于海关责任，那么就要看贵公司与报关代理人之间有无相关约定，没有约定的话，就要进行协商了。协商不成，只有通过法律渠道解决。
